Quiz about Omicron variant

On 26 November 2021, WHO designated the variant B.1.1.529 a variant of concern, named Omicron: https://www.who.int/news/item/28-11-2021-update-on-omicron

A VOC is a variant for which there is evidence of an increase in transmissibility OR more severe disease (for example, increased hospitalizations or deaths) OR significant reduction in neutralization by antibodies generated during previous infection or vaccination OR  reduced effectiveness of treatments or vaccines, OR diagnostic detection failures.

Why Omicron has been classified as VOC?

• Potential increased transmissibility
• Potential reduction in neutralization by some EUA monoclonal antibody treatments
• Potential reduction in neutralization by post-vaccination sera

A VOC is a variant for which there is evidence of an increase in transmissibility, more severe disease (for example, increased hospitalizations or deaths), significant reduction in neutralization by antibodies generated during previous infection or vaccination, reduced effectiveness of treatments or vaccines, or diagnostic detection failures.

Why Omicron has been classified as VOC?

• Potential increased transmissibility
• Potential reduction in neutralization by some EUA monoclonal antibody treatments
• Potential reduction in neutralization by post-vaccination sera

L’analyse des séquences a montré que par rapport au virus originel, ce nouveau variant renferme 30 mutations**, 3 petites délétions (pertes de matériel génétique) et une petite insertion, toutes situées dans le gène codant la protéine spike, protéine qui se lie au récepteur cellulaire ACE2 afin de permettre au virus de pénétrer dans les cellules qu’il infecte. Il y a un plus grand nombre de changements dans la protéine spike du variant B.1.1.529/Omicron que dans tout autre variant SARS-Cov-2 séquencé jusqu’à présent.

Parmi les mutations observées dans la protéine spike, celles situées en position 484 (E484A), 446 (G446S), 417 (K417N) et 493 (Q493R) retiennent particulièrement l’attention des chercheurs. En effet, il s’agit de mutations qui se situent dans des sites (épitopes majeurs) fortement impliqués dans l’échappement immunitaire (peak escape sites), autrement dit dans une diminution de la capacité de neutralisation des anticorps. En d’autres termes, on peut craindre que cela empêche la reconnaissance de la protéine spike par la grande majorité des anticorps produits, même lorsque ceux-ci sont dirigés contre plusieurs motifs différents de cette protéine  (réponse polyclonale).

Référence:

Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

because

humoral immunity escape; higher risk of reinfection in individuals previously infected with a different strain